松江综合保税区由松江出口加工区整合升级而成。原松江出口加工区于2000年4月27日经国务院批复设立，是全国首批、上海首家出口加工区。
2018年9月4日，国务院批复同意松江出口加工区整合优化为松江综合保税区，2019年9月12日，松江综合保税区通过联合验收组验收，2019年9月27日经海关总署批复同意验收结果，2019年10月28日正式揭牌。园区由A区和B区组成，总封关面积4.10平方公里，其中A区2.88平方公里，B区1.22平方公里。
目前，松江综合保税区共计落户企业148家，除了广达、国基、豪威等骨干企业外，已吸引恒大国能新能源汽车、星域控制系统、金安国纪等知名企业落户。2018年园区完成工业总产值1467亿元，进出口总额287亿美元，进出口额位于全国出口加工区第一位，海关特殊监管区第八位。2019年上半年完成工业总产值659亿元，进出口总额129亿美元，进出口额位于全国出口加工区第一位，海关特殊监管区第八位。（由于2019年6月松江综合保税区未验收，故依旧按照“松江出口加工区”名义统计经济数据）。
综合保税区是经国务院批准，设立在内陆地区，以虚拟港口为依托，在特定区域内，具有保税港区功能的海关特殊监管区域，由海关参照《中华人民共和国海关保税港区管理暂行办法》进行管理，执行保税港区的税收和外汇政策，集保税区、保税物流园区、出口加工区、港口的功能于一身，可以发展国际中转、配送、采购、转口贸易和出口加工等业务。它是除自贸试验区外，开放层次最高、优惠政策最多、功能最齐全、手续最简化的海关特殊监管区域。目前，松江综合保税区适用“跨境电商”、“一般纳税人”、“货物分类监管”等试点政策，G60科创走廊产业发展政策以及《国务院关于促进综合保税区高水平开放高质量发展的若干意见》（简称“二十一条”）相关政策。
松江出口加工区升级为松江综合保税区，是新时代国家赋予的又一次发展机遇，增强了对外开放优势，提高了G60科创走廊的核心竞争力。作为G60科创走廊的战略枢纽，松江综合保税区为“一廊九区”搭建了进口、转口、出口的重要平台，肩负着联动九城、辐射长三角的重大使命。松江综合保税区将积极对标《国务院关于促进综合保税区高水平开放高质量发展的若干意见》，服从服务长三角一体化发展国家战略，推进长三角G60科创走廊建设，聚焦人工智能、集成电路、生物医药等“6+X”产业集群发展，以做精做强加工制造中心为基础，以大力打造物流分拨中心为重点，以努力发展研发设计中心、检测维修中心、销售服务中心为新动能、新方向，打造成为深化制度型对外开放的新高地、连接国内国际两个市场的新平台、促进产业高质量发展的新载体。
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